Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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