Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rexo1Q7TT28 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rexo1Q7TT28 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rexo1Q7TT28 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rexo1Q7TT28 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rexo1Q7TT28 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rexo1Q7TT28 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rexo1Q7TT28 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rexo1Q7TT28 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rexo1Q7TT28 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rexo1Q7TT28 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rexo1Q7TT28 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms