Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LnpkQ7TQ95 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms