Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Shq1Q7TMX5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Shq1Q7TMX5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Shq1Q7TMX5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Shq1Q7TMX5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Shq1Q7TMX5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Shq1Q7TMX5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms