Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms