Protein–RNA interactions for Protein: Q78TU8

Fam107a, Family with sequence similarity 107, member A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107aQ78TU8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam107aQ78TU8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms