Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cspg5Q71M36 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cspg5Q71M36 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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