Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88cQ6VGS5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms