Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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Atp8b3Q6UQ17 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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Atp8b3Q6UQ17 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atp8b3Q6UQ17 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atp8b3Q6UQ17 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atp8b3Q6UQ17 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atp8b3Q6UQ17 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atp8b3Q6UQ17 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atp8b3Q6UQ17 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Atp8b3Q6UQ17 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Atp8b3Q6UQ17 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Atp8b3Q6UQ17 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Atp8b3Q6UQ17 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Atp8b3Q6UQ17 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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