Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmeff1Q6PFE7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmeff1Q6PFE7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmeff1Q6PFE7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmeff1Q6PFE7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmeff1Q6PFE7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmeff1Q6PFE7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmeff1Q6PFE7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmeff1Q6PFE7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmeff1Q6PFE7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tmeff1Q6PFE7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tmeff1Q6PFE7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmeff1Q6PFE7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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