Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trak1Q6PD31 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms