Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms