Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atl2Q6PA06 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms