Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms