Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgd6Q69ZL1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms