Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc2Q69ZB8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms