Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp7bQ64446 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp7bQ64446 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms