Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sall3Q62255 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms