Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sin3bQ62141 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms