Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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AtrxQ61687 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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AtrxQ61687 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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AtrxQ61687 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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AtrxQ61687 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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AtrxQ61687 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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AtrxQ61687 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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AtrxQ61687 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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AtrxQ61687 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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AtrxQ61687 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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AtrxQ61687 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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AtrxQ61687 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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AtrxQ61687 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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