Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tfap2bQ61313 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tfap2bQ61313 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms