Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna2Q61301 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna2Q61301 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna2Q61301 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna2Q61301 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna2Q61301 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms