Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cln3Q61124 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cln3Q61124 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cln3Q61124 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms