Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stxbp3Q60770 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms