Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms