Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sft2d1Q5SSN7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms