Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim58Q5NCC9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim58Q5NCC9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms