Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eme2Q56A04 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eme2Q56A04 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms