Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms