Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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Lrrc43Q3V0L5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Lrrc43Q3V0L5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Lrrc43Q3V0L5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc43Q3V0L5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Lrrc43Q3V0L5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Lrrc43Q3V0L5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Lrrc43Q3V0L5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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Lrrc43Q3V0L5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrrc43Q3V0L5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc43Q3V0L5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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