Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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