Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms