Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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