Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms