Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21440Q3TTD8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms