Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TQQ9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q3TQQ9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms