Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms