Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gdpgp1Q3TLS3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms