Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc13Q3TIR1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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