Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cpne9Q1RLL3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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