Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Fam171bQ14CH0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Fam171bQ14CH0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam171bQ14CH0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms