Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc39dQ0VF76 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms