Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vps8Q0P5W1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms