Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700061G19RikQ08EE8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700061G19RikQ08EE8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms