Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms