Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms