Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apoc2Q05020 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms