Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms