Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms