Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms